Článek
Tento dopis zůstával dosud veřejnosti utajen. Rozporuje přitom slova premiéra Andreje Babiše (ANO), že střet zájmů ukončil a EU nemá důvod ho dále řešit.
Evropská komise totiž i poté, co Babiš v únoru vložil Agrofert do svěřenského fondu, oficiálně požadovala po Česku garanci, že miliardové zemědělské dotace pro Agrofert zůstávají zmrazeny.
„Potvrďte nám prosím, že pozastavení bylo účinně uplatněno a že od uvedeného data (Babišova nástupu do křesla premiéra, pozn. red.) nebyly společnosti Agrofert vyplaceny žádné platby,“ napsala v polovině března do Prahy šéfka ředitelství Evropské komise pro zemědělství Elisabeth Wernerová. S tím, že Komise považuje účinné předcházení střetům zájmů „za nejvýše důležité“.
Wernerová dotazy adresovala českému Ministerstvu zemědělství, které vede Martin Šebestyán (za SPD), který před nástupem do křesla ministra fungoval jako lobbista Agrofertu. Podle zdrojů Seznam Zpráv blízkých jednáním zároveň při neformální komunikaci s českými úředníky Evropská komise signalizovala, že Česko zatím nemá Agrofertu nic proplácet.
Šebestyánův resort oficiální komunikaci přesměroval na podřízený Státní zemědělský intervenční fond (SZIF). Ten Evropské komisi odpověděl o měsíc později. „SZIF od data 9. 12. 2025 nevyplatil žádné ze společností spadajících do koncernu Agrofert dotace, které jsou financované či kofinancované z evropských fondů,“ ujistil Brusel ředitel fondu Petr Dlouhý.
I tuto listinu mají Seznam Zprávy k dispozici. Ředitel Dlouhý v ní dále bez podrobností napsal, že Babišovo řešení střetu zájmů za pomoci svěřenského fondu prověřuje.
A za dva týdny miliardy odblokovali
Do Bruselu odešla jeho reakce ve stejný den, kdy advokátní kancelář Portos dodala fondu na základě osmimilionové rámcové smlouvy právní posudek, podle něhož ani evropské právo nebrání dalšímu vyplácení dotací Agrofertu.
O dalších devět dnů později SZIF dotační toky Babišovým firmám opět otevřel. A to bez stanoviska Evropské komise.

Jedna z pasáží dopisu, který Ministerstvu zemědělství poslala Evropská komise.
Zemědělský fond tak postupoval přesto, že Elisabeth Wernerová ve svém dopise Česko speciálně varovala, že je povinno dodržovat článek 61 evropského finančního nařízení, s nímž podle mnohých expertů Babišovo řešení střetu zájmů zůstává v konfliktu. Wernerová doslova žádá o formální potvrzení, že i po jmenování Babiše předsedou vlády je daný článek plněn.
„Generální ředitelství Evropské komise pro zemědělství a rozvoj venkova by uvítalo podrobné informace o konkrétních opatřeních, která české orgány přijaly k řešení skutečných, potenciálních nebo vnímaných rizik střetu zájmů při řízení a kontrole finančních prostředků EU,“ snažila se zjistit vysoce postavená evropská úřednice.
Všechno dodržujeme, tvrdí
Na tento požadavek evropské úřednice Wernerové ředitel zemědělského fondu Dlouhý odepsal, že evropské nařízení proti střetu zájmů dodržuje, protože například po žadatelích o dotace chce, aby sami nahlásili vazby na politiky nebo úředníky. Agrofert by tedy musel nahlásit sám sebe.

Úryvek z odpovědi šéfa Státního zemědělského intervenčního fondu zaslané do Bruselu.
To ale nestačí. Komise ve svých vlastních pokynech k opatřením proti střetu zájmů píše, že poskytovatel mu musí sám aktivně přecházet, odhalovat jej a aktivně řešit.
Zdroje Seznam Zpráv blízké institucím, které s Evropskou komisí jednají, přitom upozorňují, že je vysoká pravděpodobnost, že s obecnými oficiálními vysvětleními Česka nebude Brusel spokojený.
Narazí kvůli utajenému statutu Babišova fondu?
- Experti argumentují, že klíč obsahuje neveřejný statut fondu, který premiér Andrej Babiš tajil. Zveřejnily ho až Seznam Zprávy.
- Babiš totiž sice tvrdil, že se navždy vzdal Agrofertu a jeho děti ho dostanou až po jeho smrti, reálně ale už s Babišovým koncem v politice bude fond řídit rada složená z jeho dětí. Těm navíc nic nebrání učinit Babiše správcem fondu, čím by znovu dostal pod kontrolu i Agrofert.
Evropská komise už do Česka poslala druhou sadu otázek.
Prověřování možného střetu zájmů premiéra Babiše spustila už v únoru listinou odeslanou na Ministerstvo pro místní rozvoj, což bylo ještě předtím, než Babiš vložil Agrofert do svěřenského fondu. I v tomto případě se od resortu Zuzany Mrázové (ANO) dočkala jen obecné odpovědi.
A jak už Seznam Zprávy napsaly, někdo přitom českým úředníkům zarazil pokus si v této odpovědi vyžádat od Bruselu stanovisko, zda nový Babišův svěřenský fond splňuje evropské právo. Někteří státní experti totiž také mají závažnou pochybnost, že je s evropským nařízením svěřenský fond v souladu. Kdo dotaz z dopisu vyhodil, Ministerstvo pro místní rozvoj dodnes tají.
Utajené posudky zveřejněny
Pakliže celkem tři angažovaná ředitelství Evropské komise opravdu nebudou s těmito reakcemi českých úřadů spokojená, spustí formální audit.
Ten může skončit tím, že EU nařídí peníze vyplacené Agrofertu vrátit, takže by dotace zaplatil český státní rozpočet a až následně by se je po holdingu mohl pokusit vymáhat peníze zpět. Získat verdikt EU může trvat i roky, takže mezitím do holdingu natečou miliardy.
Hra o miliardy pro Babiše
20. 2. – Premiér Andrej Babiš vložil Agrofert do svěřenského fondu. Tvrdí, že jeho střet zájmů je vyřešen i na úrovni EU.
11. 3. – Evropská komise v dopise žádá ujištění, že dotace pro Agrofert jsou zmrazené a Česko dodržuje evropské nařízení proti střetu zájmů.
13. 4. – Státní zemědělský intervenční fond (SZIF) ujišťuje EU, že Agrofertu zemědělské dotace neposílá, střetu zájmů předchází a Babišovo řešení střetu zájmů teprve zkoumá.
22. 4. – Dotace Agrofertu rozmrazeny, informuje zemědělský fond, aniž by chtěl znát stanovisko Evropské komise.
Právní tým protikorupční organizace Transparency International, který se střetu zájmů Andreje Babiše dlouhodobě věnuje, postup Česka kritizuje.
„SZIF se pod vedením Petra Dlouhého rozhodl vydat po velmi rizikové cestě, kterou již před lety velmi loajálně Andreji Babišovi vyšlapal jeho někdejší předchůdce a nynější ministr zemědělství Martin Šebestyán (za SPD). Andrej Babiš doposud svůj střet zájmů skrze RSVP Trust nevyřešil a občanům neřekl pravdu o nastavení celého svěřenského fondu,“ uvedl ředitel české pobočky protikorupční organizace Transparency International David Kotora.
Zemědělský fond odblokování peněz podkládá posudky dvou soukromých advokátních kanceláři, které se nejprve pokusil utajit. Po dotazech Seznam Zpráv a tlaku veřejnosti i parlamentní opozice ale nakonec otočil a zveřejnil je. Ty poslední v pondělí.
Ukázalo se tak, že samy tyto posudky upozorňují, že EU může mít jiný názor. Transparency International navíc kritizuje jejich odbornou úroveň. „Posudky advokátních kanceláří jsou velmi slabou oporou pro rozhodnutí SZIF opětovně umožnit čerpat dotace pro společnosti premiéra,“ dodal Kotora.
Investigativní série o Babišově střetu zájmů

Andrej Babiš a jeho střet zájmů.
Co skrývá statut Babišova fondu:
Jak stát (ne)vymáhá dotace po Agrofertu:
- Babišova vláda skrytě odklepla 250 milionů, které může čerpat Agrofert
- Symbolická částka, hájí ministr čtvrt miliardy, k níž otevře dveře Agrofertu
- Zemědělský fond couvá. Agrofertu to může zachránit čtyři miliardy
- Našel se dokument, že Agrofert neměl dostat miliardy. Babiš tvrdil, že neexistuje
- Zvrat ve vymáhání miliard po Agrofertu: Ministerstvo otočilo, nechce zatím ani korunu
Kdo (ne)řeší střet Andreje Babiše:
- Úředníci vidí, že za dotace pro Agrofert můžeme zaplatit, ale bojí se, říká novinář
- Fond po tlaku zveřejnil posudek, který Agrofertu přinese miliardy
- Česko obnoví miliardové dotace pro Agrofert. Opírá se o utajené posudky
- Ministerstvo tutlá, kdo zarazil dotazy na Babišův střet zájmů
- Úředníci chtěli v Bruselu zjišťovat, zda Babiš dodržel zákon. Dostali stopku
- Evropská komise začala prověřovat Babišovo řešení střetu zájmů
- Ministr je podle rejstříku pořád lobbistou Agrofertu
- Podporu Agrofertu sepsal na ministerstvu úředník, jehož platili lobbisté
- Do přední funkce se vrací právnička, která podepsala, že Babiš nemá střet zájmů














